Ruang kelas SMAN 3 Semarang didesain sesuai karakteristik mata pelajaran, hal ini dikarenakan SMAN 3 menggunakan model pembelajaran moving class, dimana siswa berpindah ruang kelas setiap berganti mata pelajaran.  Ruang kelas yang tersedia sejumlah 44 yang tersebar ke beberapa gedung, diantaranya gedung B,C, dan gedung D. Ruag kelas yang ada dilengkapi dengan :

• Pendingin udara (AC)
• LCD proyektor
• Whiteboard
• Almari koleksi menyimpan karya dan koleksi buku mata pelajaran,
• Jaringan Hotspot di setiap kelas dengan kecepatan mencapai 100 mbps,
• Loker siswa untuk menyimpan peralatan sekolah siswa.
• Tempat cuci tangan di depan setiap kelas
• Pengukur suhu tubuh